Taiyo Furusato fue el más rápido en el segundo entrenamiento del GP de Malasia de Moto3. Sin embargo, el piloto no pudo superar los mejores registros de la sesión inaugural en Sepang.
Masiá reiteró su posición, Deniz Öncü (Red Bull KTM Ajo) se convirtió en el segundo clasificado antes de superar al rival. Kaito Toba (SIC58 Squadra Corse/Honda) estaba en tercer lugar en ese momento antes de ser superado por algunos rivales. Collin Veijer (Liqui Moly Husqvarna Intact GP) pasó al tercer puesto.
Transcurrieron varios minutos sin cambios significativos en la tabla de tiempos. Los tres primeros fueron los únicos que habían rodado en 2m13s en estos primeros ataques al cronómetro.
Cambios de líder a seis minutos del final, con Daniel Holgado (Red Bull KTM Tech3) superando a Öncü, poco antes de ser superado por Ayumu Sasaki (Liqui Moly Husqvarna Intact GP). Ambos rodaron en 2m12s. En los minutos siguientes, hubo muchos más cambios en la tabla de tiempos.
Holgado reforzó el liderazgo, pero luego fue superado por Furusato (Honda Team Asia) y Matteo Bertelle (Rivacold Snipers Team/Honda). Hasta el final, nadie superó a Furusato, quien lideró la sesión a pesar de terminar con una caída.
Alonso estuvo cerca, a 37 milésimas, mientras que Bertelle fue tercero. Holgado y Adrián Fernández (Leopard Racing/Honda) completaron el top cinco. Masiá fue séptimo y no mejoró en comparación con el primer entrenamiento, pero aún así su tiempo en esa sesión fue el mejor del día.
Tiempos P2:
Tabela de tiempos combinada P1 + P2:
