Jorge Martín dominou a qualificação do GP do Japão de MotoGP para garantir a pole position para as corridas de Motegi. Logo na sua segunda volta estabeleceu um novo tempo recorde do circuito, para nunca ser ultrapassado.
Logo no início da Q2, Marco Bezzecchi (Mooney VR46 Racing Team/Ducati) perdeu a frente da sua moto e sofreu uma queda forte. Sem mazelas físicas significativas, apanhou rapidamente boleia pela via de serviço de modo a regressar às boxes e subir à sua segunda moto.