Per la quinta volta questa stagione, Iván Ortolá partirà dalla pole position nella Moto3. Il pilota è stato il più veloce nelle qualifiche del GP del Giappone, stabilendo un nuovo giro record a Motegi in 1m54,761s.
Collin Veijer (Liqui Moly Husqvarna Intact GP) è stato il primo leader della Q1, inseguito da David Alonso (CFMOTO Gaviota Aspar) che è stato 0,304s più lento nei primi giri lanciati. Joel Kelso (BOE Motorsports/KTM) era in terza posizione.
Ortolá (MT Helmets-MSi/KTM) è stato il pilota successivo in cima alla classifica, relegando Veijer al secondo posto per 0,387s, mentre Alonso è passato a essere terzo e Ángel Piqueras (Leopard Racing/Honda) quarto.
Negli ultimi cinque minuti, Ryusei Yamanaka (MT Helmets-MSi/KTM) è arrivato in terza posizione e, dopo, è stato per un momento in seconda prima che Veijer recuperasse il posto. E l’olandese è riuscito a conquistare la leadership nell’ultimo minuto.
Tuttavia, Ortolá ha fatto ancora meglio essendo l’unico a girare in 1m54s (1m54,761s) per assicurarsi la pole position, battendo Veijer di ben 0,356s. Alonso ha garantito la terza posizione a 0,409s, e il suo principale inseguitore nel campionato, Daniel Holgado (Red Bull GasGas Tech3), è stato relegato al nono posto.
