Jorge Martín dominó la clasificación del GP de Japón de MotoGP para asegurar la pole position para las carreras de Motegi. En su segunda vuelta estableció un nuevo tiempo récord en el circuito, que nunca sería superado.
Al comienzo de la Q2, Marco Bezzecchi (Mooney VR46 Racing Team/Ducati) perdió el control de su moto y sufrió una fuerte caída. Sin lesiones físicas significativas, rápidamente consiguió un pase por el camino de servicio para regresar a boxes y subir a su segunda moto.